Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 2,006 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Scn2aA0A0J9YTW6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Scn2aA0A0J9YTW6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Scn2aA0A0J9YTW6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Scn2aA0A0J9YTW6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scn2aA0A0J9YTW6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Scn2aA0A0J9YTW6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn2aA0A0J9YTW6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn2aA0A0J9YTW6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn2aA0A0J9YTW6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Scn2aA0A0J9YTW6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn2aA0A0J9YTW6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn2aA0A0J9YTW6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn2aA0A0J9YTW6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn2aA0A0J9YTW6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn2aA0A0J9YTW6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scn2aA0A0J9YTW6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn2aA0A0J9YTW6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scn2aA0A0J9YTW6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
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Scn2aA0A0J9YTW6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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