Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B654

Trav3-4, T cell receptor alpha variable 3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav3-4A0A075B654 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trav3-4A0A075B654 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trav3-4A0A075B654 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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