Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Pdpk1Q9Z2A0 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Pdpk1Q9Z2A0 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Pdpk1Q9Z2A0 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pdpk1Q9Z2A0 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Pdpk1Q9Z2A0 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Pdpk1Q9Z2A0 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Pdpk1Q9Z2A0 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Pdpk1Q9Z2A0 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Pdpk1Q9Z2A0 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pdpk1Q9Z2A0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms