Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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Trim39Q9ESN2 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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