Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rnf6Q9DBU5 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rnf6Q9DBU5 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Rnf6Q9DBU5 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Rnf6Q9DBU5 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rnf6Q9DBU5 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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