Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm38910-201ENSMUST00000204630 2448 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
SrrdQ8K2M3 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms