Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Csnka2ipQ8CH19 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
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