Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atg16l1Q8C0J2 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Atg16l1Q8C0J2 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Atg16l1Q8C0J2 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Atg16l1Q8C0J2 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Atg16l1Q8C0J2 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Atg16l1Q8C0J2 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atg16l1Q8C0J2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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