Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Dsg1bQ7TSF1 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Dsg1bQ7TSF1 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Dsg1bQ7TSF1 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Dsg1bQ7TSF1 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Dsg1bQ7TSF1 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Dsg1bQ7TSF1 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Dsg1bQ7TSF1 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Dsg1bQ7TSF1 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Dsg1bQ7TSF1 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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