Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rnf149Q3U2C5 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms