Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm44908-201ENSMUST00000208610 266 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Samd11Q1RNF8 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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