Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Thbs2Q03350 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms