Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GscQ02591 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm45336-201ENSMUST00000210010 3230 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm10634-202ENSMUST00000188891 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GscQ02591 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms