Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pde1bQ01065 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms