Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
H3f3aP84244 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
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