Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CntfP51642 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CntfP51642 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CntfP51642 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CntfP51642 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
CntfP51642 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
CntfP51642 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CntfP51642 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CntfP51642 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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