Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Use1Q9CQ56 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Use1Q9CQ56 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms