Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Sh2d1a-203ENSMUST00000115070 782 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lrit1Q8K099 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 AC156274.1-201ENSMUST00000219193 634 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 1700029N11Rik-203ENSMUST00000220639 1092 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 AC161877.1-201ENSMUST00000227736 699 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Lrit1Q8K099 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Lrit1Q8K099 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 4930547H16Rik-201ENSMUST00000222281 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Olfr1349-201ENSMUST00000051982 1054 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm33466-201ENSMUST00000199819 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lrit1Q8K099 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Lrit1Q8K099 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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