Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sh3rf1Q69ZI1 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms