Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nhlrc4Q3UP44 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Nhlrc4Q3UP44 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms