Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm17207-201ENSMUST00000168686 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm38233-201ENSMUST00000194259 807 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Samd11Q1RNF8 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms