Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 2810006K23Rik-201ENSMUST00000077376 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm11948-201ENSMUST00000142322 539 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm43894-201ENSMUST00000203274 688 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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