Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Cass4-203ENSMUST00000109136 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Msh4-203ENSMUST00000188338 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Tle3-208ENSMUST00000160882 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Epb41l3-201ENSMUST00000080208 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Kcnh6-201ENSMUST00000001965 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Cdkl5-201ENSMUST00000087104 3269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Zdhhc9-201ENSMUST00000037960 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Apod-203ENSMUST00000130560 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Nuggc-202ENSMUST00000150897 2745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Nt5c1b-217ENSMUST00000219826 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Dgcr2-204ENSMUST00000117945 4003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Pcdhb5-201ENSMUST00000078271 3535 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Snx25-201ENSMUST00000041582 3206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Rab3il1-203ENSMUST00000121418 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Mep1a-201ENSMUST00000024707 2921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Irx2P81066 Phka2-201ENSMUST00000033652 4133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Rufy4-201ENSMUST00000080167 2306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 2310043P16Rik-201ENSMUST00000205403 3881 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Mcm5-201ENSMUST00000164309 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Scnn1a-207ENSMUST00000177329 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Tuba4a-202ENSMUST00000186213 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Zfp446-203ENSMUST00000108536 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Egf-202ENSMUST00000197079 3346 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Acot11-201ENSMUST00000065253 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Washc5-202ENSMUST00000227725 2618 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Mbnl3-201ENSMUST00000041495 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Irx2P81066 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms