Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Syncrip-207ENSMUST00000174269 3286 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Cd8a-201ENSMUST00000066747 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms