Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm8506-201ENSMUST00000186661 829 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm10247-201ENSMUST00000090395 333 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Dcdc2c-204ENSMUST00000189735 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxa2P31245 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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