Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Irf1P15314 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm37373-201ENSMUST00000194005 2812 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm13033-201ENSMUST00000117591 1057 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Irf1P15314 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms