Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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