Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm20939L7N243 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms