Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm20696H3BJN7 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm20696H3BJN7 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.3 ms