Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trim39Q9ESN2 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms