Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Olfr654-201ENSMUST00000098173 1155 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm11621-201ENSMUST00000118253 589 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm12860-201ENSMUST00000148457 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm24065-201ENSMUST00000157487 264 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm23081-201ENSMUST00000157845 297 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Znrf1-215ENSMUST00000174454 494 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm29142-201ENSMUST00000188009 696 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Lamtor3-203ENSMUST00000197064 733 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 AC129537.1-201ENSMUST00000226596 1228 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 9030619P08Rik-201ENSMUST00000096397 857 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 AC140209.1-203ENSMUST00000227412 1524 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 1700023G09Rik-201ENSMUST00000194513 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Riok3Q9DBU3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms