Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Med27Q9DB40 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Med27Q9DB40 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Med27Q9DB40 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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