Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Trappc12Q8K2L8 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
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Trappc12Q8K2L8 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Trappc12Q8K2L8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Trappc12Q8K2L8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Trappc12Q8K2L8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc12Q8K2L8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Trappc12Q8K2L8 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms