Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Pnma8aQ80VM8 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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