Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
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Ccdc88cQ6VGS5 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ccdc88cQ6VGS5 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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