Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Smt3h2-ps2-201ENSMUST00000122370 288 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Scgb3a1-201ENSMUST00000043873 493 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Scgb3a1-202ENSMUST00000076006 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Ccdc18Q640L5 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc18Q640L5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 B130024G19Rik-204ENSMUST00000191084 634 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm36172-201ENSMUST00000219852 723 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc18Q640L5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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