Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Skap2Q3UND0 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms