Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rundc1Q0VDN7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rundc1Q0VDN7 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms