Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxrgP28705 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RxrgP28705 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RxrgP28705 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxrgP28705 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms