Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm2035J3QP87 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm2035J3QP87 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm2035J3QP87 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm2035J3QP87 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm2035J3QP87 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm2035J3QP87 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm2035J3QP87 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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