Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17555F6U8B9 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm17555F6U8B9 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm17555F6U8B9 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Gm17555F6U8B9 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17555F6U8B9 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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