Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Gm6880A3KG45 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms