Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lcn6A2AJB9 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms