Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 F730016J06Rik-201ENSMUST00000126140 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PtprfA2A8L5 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms