Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Apobec3Q99J72 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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