Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cdkl1Q8CEQ0 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms