Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nup88Q8CEC0 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nup88Q8CEC0 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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