Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gm498-202ENSMUST00000152910 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Pzp-201ENSMUST00000112132 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Map1a-202ENSMUST00000110639 10145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gcc1-201ENSMUST00000064377 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ap3s2Q8BSZ2 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms