Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm7047-201ENSMUST00000196224 1063 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trak1Q6PD31 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trak1Q6PD31 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms