Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Atg9bQ6EBV9 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms